Der aktuelle Export erhält immer die Datei- und Ordner-Benamung (file und directory naming) wie im Feld Export Pfad im Export Profil definiert. Ältere Exporte desselben docWORKS[e]-Dokumentes werden umbenannt und mit einem Index-Zähler versehen. Dies geschieht auf Ordner-Ebene, der den Export beinhaltet. Damit es beim erneuten Export des Dokuments nicht zu Fehlern kommt, müssen sämtliche Dateien des alten Exportes und auch die Ordner (z.B. im Total Commander) geschlossen werden.